Diversity of the internal transcribed spacer of rDNA in morels

Daniel Wipf, Anne Fribourg, Jean Charles Munch, Bernard Botton, and François Buscot

Abstract: The internal transcribed spacer (ITS) of rDNA was analysed by PCR/RFLP in 66 strains belonging to 11 putative species of the Morchellaceae and 3 species of the Discinaceae. For certain taxa, in particular Morchella esculenta, Morchella conica, and Morchella elata, isolates from distant geographical origins were available. Nevertheless, no intraspecific variations of ITS length and restriction was noted. All genera were separated and within Morchella; four putative species could be clearly distinguished in the group of the yellow morels (sectio adnatae). In contrast, no distinction could be obtained between the compared taxa in the group of the black morels (sectio distantes). Sequence analyses of the ITS were performed in one strain of seven putative Morchella. The sequence comparison confirmed the distinctions within the yellow morels and allowed us to separate one putative taxon from the others in black morels. Only the 5,8 gene could be aligned in all sequenced samples. The ITS1 and ITS2 sectors could only be aligned within the black and yellow morels, respectively. The genetic and phylogenetic distances between black and yellow morels, respectively revealed by maximum parsimony and neighbour joining analyses, both confirm the great distance between these species groups and address the question of a separation in the genus Morchella.

Key words: Morchellaceae, Discinaceae, ITS.

Résumé : L'espaceur intergénique transcrit (ITS) de l'ADNr a été analysé par PCR/RLFP chez 66 souches appartenant à 11 espèces putatives de Morchellaceae et 3 espèces de Discinaceae. Dans le cas de certains taxa, en particulier Morchella esculenta, M. conica et M. elata, des isolats provenaient de régions géographiques éloignées. Néanmoins, aucune variation intraspécifique de la longueur des ITS et de la restriction n'a été observée. Tous les genres ont été séparés et, chez Morchella, quatre espèces putatives ont pu être clairement distinguées dans le groupe des morilles jaunes (sectio adnatae). Par contre aucune distinction n'a pu être faite parmi les taxa comparés dans le groupe des morilles noires (sectio distantes). Des analyses de séquence de l'ITS ont été faites chez une des sept souches putatives de Morchella. La comparaison des séquences a confirmé les disparités parmi les morilles jaunes et nous a permis de reconnaître un taxon putatif parmi les autres chez les morilles noires. Seul le gène 5,8 a pu être aligné dans tous les échantillons séquencés. Les secteurs ITS1 et ITS2 ont pu être alignés chez les morilles jaunes et les morilles noires respectivement. Les distances génétiques et phylogénétiques entre les morilles noires et les jaunes révélées respectivement par des analyses de parcimonie maximale et de neighbour-joining, ont toutes deux confirmé qu'il y avait un grand écart entre ces groupes d'espèces, ce qui pose la question d'une séparation dans le genre Morchella.

Mots clés : Morchellaceae, Discinaceae, ITS.

[Traduit par la Rédaction]